Lietuvos Respublikos valstybės kontrolė 2015 metais atliko valstybinį veiklos auditą „Ar pasiekti mokyklų aprūpinimo geltonaisiais autobusais programų tikslai“.
Šio audito ataskaitą Švietimo, mokslo ir kultūros komitetas svarstė 2016 metų balandžio 6 d. posėdyje. Komitetas susipažino su audito autorių teikiamu rekomendacijų įgyvendinimo planu ir iš esmės jam pritarė.
Komitetas pasiūlė Švietimo ir mokslo ministerijai tikslinti geltonųjų autobusų skirstymo savivaldybėms papildomus kriterijus, kuriais vadovaujantis būtų užtikrinamas didesnis skaidrumas ir objektyvumas, ir paprašė, kad ministerija nuolat vykdytų sistemišką geltonųjų autobusų įsigijimo ir panaudojimo stebėseną ir analizę, nuolat didintų vežiojamų mokinių saugumą. Pasiūlyta Vyriausybei rengiant valstybės biudžeto projektą numatyti pakankamai lėšų geltoniesiems autobusams nupirkti, kad būtų užtikrintas mokinių vežiojimas į mokyklas pagal įstatymus ir nustatytus kriterijus.